而面向21世纪，我们面临的是以“和平与发展”为主题的崭新时代，现代科技革命与经济全球化两大潮头代表时代主流。正是在这种新的形势下，“三个代表”思想坚持和发展了邓小平理论，要求中国共产党作为中国工人阶级先进政党，最重要的工作重心不是再搞阶级斗争，而是代表先进生产力、先进文化和广大人民利益、人民民主的未来发展方向。
第二，“三个代表”体现了创新主体的重大创新
在当代国际上流行的创新理论中，往往对创新主体做出不同规定：把企业与企业家作为技术创新主体；把科学家、科学院、大学作为科学创新、知识创新主体；把国家政府作为政策创新、体制创新主体……但很少专门探讨党的创新、执政党的创新、工人阶级执政党的创新主体作用问题。
“三个代表”的重要思想，则解放思想，实事求是，从中国国情实际出发，专门探讨了中国共产党作为工人阶级执政党的全面创新问题，把党作为创新主体，作为中国国家创新体系的核心力量，这不愧是一个理论与实践统一的重大创新。
第三，“三个代表”体现了中国国家创新体系的独特创新
在目前已有的国家创新体系中，较有影响的是美国模式与日本模式。
美国式国家创新体系，显著特点是强调科学创新与技术创新结合，特别突出企业与企业家在技术创新中的主体作用，在一定意义上或许可称之为“企业主体型国家创新体系”。
日本式国家创新体系，过去比较突出与市场结合的技术创新，特别强调政府通产省在技术创新中的主导作用，在一定意义上或许可称之为“政府主导型国家创新体系”。
中国在认真学习借鉴美、日等发达国家创新体系的同时，也努力开创有自己特色的国家创新体系，显著特点之一，就是把中国共产党作为国家创新体系的能动主体之一，并作为领导多元主体综合创新的核心力量与整合机制，或许可称为“党领导型国家创新体系”。
三大振兴的历史使命
高度概括地说，江泽民与第三代领导集体提出“三个代表”的重要思想，最根本的目的就是要使21世纪中国共产党实现三大振兴的伟大历史使命：振兴党风——振兴中华——振兴社会主义。
（一）提出“三个代表”的重要思想，首先是为了“振兴党风”，解决党内存在的突出问题，克服官僚腐败、不正之风，使21世纪中国共产党成为建设有中国特色社会主义的核心力量，中国式国家创新体系的能动主体与多元主体中的主导力量。
正在迎来建党80周年的中国共产党，以“过五关斩六将”的开拓奋斗精神，经历了一系列重大历史考验：
从地下党，转变为执政党；
从武装斗争为主，转向和平建设为主；
从“以阶级斗争为纲”，转向以现代化经济建设为重心；
从传统计划经济体制，转向社会主义市场经济新型体制；
从封闭半封闭状态，走向对外开放、全面开放、参与经济全球化；
从比较单一的经济成分、经济结构，走向以社会主义公有制为主体、多种经济成分共同发展的社会主义初级阶段多层次经济结构。
总的来说，中国共产党表现出强大的生命力、战斗力、综合创新能力，历尽磨难，千锤百炼，成长壮大，不断发展。
当然，不应讳言，在改革开放、实现现代化这样一个大变革、大发展过程中，党的工作也存在一些问题，有的问题还相当突出、相当严重、相当尖锐。最大的两个问题，是精神文明建设问题与党的建设问题。最突出、最典型的表现，是官僚腐败、不正之风。
为此，江泽民和第三代领导集体，一再为我们敲响警钟：“从这些年和最近揭露出来的一些大案要案来看，一些领导干部搞权钱交易、权色交易，简直到了利令智昏、利欲熏心、胆大包天、无法无天的地步！”“如果治党不严，纪律松弛，组织涣散，发展下去，不是没有亡党亡国的危险啊！”
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