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地中海贫血基因检测

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地中海贫血简介

地中海贫血(thalassemia),又称海洋性贫血,简称地贫,是由于人体珠蛋白基因突变或者缺失而导致的某种珠蛋白链合成障碍,造成α,β-珠蛋白肽链合成速率的不平衡而导致的溶血性贫血。重型地贫会引起胎儿水肿症、贫血、甚至死亡;中间型地贫患儿需经常输血,长大基本丧失劳动能力,生活质量明显下降。地中海贫血是一种累及全世界且具有高发病率的遗传病,我国以广东、广西、海南、四川、重庆为地贫高发区(表1)。由于目前地贫尚无有效根治办法,患儿家庭背负着极大的精神压力和经济负担。地中海贫血基因诊断可在临床上对患者的基因型进行确诊,对家族成员基因型进行追踪及监控,并应用于婚前检查、产前诊断,以预防和减少重症地中海贫血儿的出生,降低地中海贫血发生率,提高人口素质

地区 广东 广西 海南(汉族) 海南(黎族) 四川、重庆 贵州 云南 台湾 香港

表1:中国南方地中海贫血人群携带率 携带率(%) α-地贫 β-地贫 8.53 2.54 17.55 6.43 12.96 2.70 56.72 11.20 1.92 2.18 4.20 1.10 3.46 7.27 5.02 3.41 5.00 3.40 地贫治疗现状

地中海贫血目前尚无有效的疗法,因而预防重型地中海贫血患儿出生是控制本病

的可行方法,为此,人群中地贫携带者的筛查、基因诊断和产前诊断显得尤为重要。常用的诊断方法如下: 1. Southern 印迹法

优点:分析缺失型α-地中海贫血分子缺陷的可靠技术 缺点:操作繁冗,不宜作为常规手段

2. 联合检测

平均红细胞参数(MCV、MCH)+红细胞脆性检测+Hb(血红蛋白)电泳 MCV:平均红细胞容积 MCH:平均红细胞血红蛋白量 优点:这一检测方法简便、迅速,也较为普及

缺点:不能有效地把缺铁性贫血区别开来,对于α-地中海贫血和β-地中海贫血的诊断也没有特异性。

3. PCR-RDB法(PCR/寡核苷酸探针反向斑点杂交法)

检测中国南方常见的17种β地贫突变:CD41~42(-TCCT)、IVS-2 nt654 C→T、-28 A→G、CD71~72(+A)、CD71~72(+T)、CD17 A→T、CD26 G→A、CD31(-C)、CD27~28(+C)、CD43 G→T、-32 C→A、-29 A→G、-30 T→C、CD14~15(+G)、CAP、Int及IVS-1 nt5 G→C

优点:在一次实验可同时辨别多种点突变,其准确性仅次于DNA测序 缺点:突变位点附近存在的多态性位点易导致假阴性结果

4. Gap-PCR

采用单管四重PCR法(多重PCR技术)对其基因组DNA进行扩增,同时检测-α3.7、-α4.2、--SEA和正常对照4种等位基因型,采用1.2%琼脂糖凝胶电泳分离扩增产物,通过片断大小判断患者的基因型。

优点:快速、简单、无放射性,可以检测缺失和重排,是目前诊断缺失型地贫的常规方法

缺点:不能检测未知的缺失突变以及非缺失型突变

5. PCR-RFLP

检测非缺失型α地贫Hb Constant Spring(HbCS) 优点:简便,快捷,经济

缺点:该方法只限于涉及限制性内切酶位点改变的突变和小片段缺失的检测

6. 基因芯片

生物芯片技术是20世纪90年代中期以来影响深远的重大科技进展。根据基因芯片上不同位置所出现的荧光位点颜色及强弱的变化来判断地贫的基因突变类型,与传统方法比较,可提高检测结果的敏感性和特异性。

优点:高通量,可将α、β地中海贫血基因诊断在一片芯片上完成,适合大面积普查。

7. DNA测序

基因测序是目前检测基因突变的金标准,能诊断已知的和未知的点突变以及小片段核苷酸缺失与插入突变。由于sanger测序法属于定性试验,不能检测α珠蛋白基因拷贝数的变化,因此不能检测大片段的缺失。下一代高通量测序技术与传统测序技术相比,可一次性对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,故能检测所有类型的地中海贫血。

数据量

基于外显子捕获的高通量测序方法 以Gb为单位

基于PCR的Sanger测序法 以bp为单位 高 差 人工 0.5个月

平均工作量 低 稳定性 分析流程 周期

半自动+人工 1个月

适用人群

(1) 临床贫血患者。

(2) 地中海贫血高危区人群(如中国华南、西南等省市)。 (3) 夫妇婚检怀疑或确诊为地贫患者或携带者。 (4) 孕中期妇女应尽早进行产前诊断。 (5) 任何关注自身健康的人群。

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